Los Padres Franciscanos Menores  llevaron la dirección de la  escuela, 22 años.  Labor  ardua y  difícil,   cimentando   la  tarea  educativa  en  tres  pilares:  

1.- Educar
2.- Evangelizar
3.- Elevar la  calidad de vida,  eliminando  la  pobreza.

A  ello  se unía  la  alimentación   y  el  aprendizaje de un oficio.
 
Los  PP. Franciscanos  Menores   dejaron  la  dirección  de la  escuela en  1978,   siendo  asumida  por la Institución  Teresiana,  con las   Srtas  Araceli  Prieto, Lourdes  Calvo y más  tarde   con  Lourdes Blanco,  dirigiendo  la  escuela hasta 1990.

Las  Hnas. Misioneras de la Providencia,  asumen  la dirección en Enero de 1991 con las  Hnas. Isabel Muñoz H,  María Teresa Notario G, como directora de Inicial y Primaria; María del Carmen Pozo,  como  directora  del  ciclo  Intermedio.  

Al  desaparecer el  nivel  Intermedio, se crea  un  nuevo  SIE para el  nivel  secundario y  también  el  nombre, quedando  la  tarde  con  “San  Juanillo!   y  el turno de la mañana  con   “  Franciscana  San  Juanillo” Con  diferente  RUE  ,  pero la  misma  infraestructura  para  Primaria  y  Secundaria.

Las  actividades se desarrollan    en  el  turno  de la  tarde,  como   se  hacía  en  el ciclo  Intermedio,  con  la  novedad  de    las  clases llamadas “ Materias  adicionales”    que se  impartían en la  mañana, desde el año 1992,  estando  avaladas por la  Resolución  Administrativa 173/ 97 , y    Resolución Prefectural Nº 072/  97.

El  año  2014,  se  consolida  el  BTH para  el  nivel  secundario,    con  las  mismas especialidades  mencionadas en las  dos  Resoluciones,   con  maestros    de especialidad   en  cada  área , recibiendo  los  estudiantes al  finalizar el Bachillerato    dos   Certificados:  humanístico  y Técnico.

Un  año  más  tarde  en  el 2015,   asume la  dirección  del  nivel  secundario  y    BTH  la  Hna. Teresa Torres  Romero,  actualmente  directora  de dicho  nivel. Se  han  alcanzado  muchos  logros, a  través de  nuestros  bienhechores,  en  todos  los  sentidos:  Proyectos,  actualización  docente,  infraestructura, mobiliario,  equipamiento …pero  sin ninguna  duda el  mayor  logro  es la  unidad de  metas, la  formación  humana y espiritual  de los estudiantes  y  el  deseo de  superación  constante  por  hacer del  centro  educativo un  lugar donde vivamos  la  fraternidad  y  la  alegría
 
El  carisma   educativo  franciscano    de  hermandad  y  fraternidad,  junto  al  cuidado de la  creación,  se  funde  con el  carisma  educativo  de las  Hnas.  Misioneras de la  Providencia, conformando  uno  solo, el  de la  antropología  cristiana, que  nos  hace a  todos hermanos, hijos  del  mismo  Padre Providente que  cuida de los hombres con amor  infinito.

El  proceso  educativo  que  viven  los  niños-as  desde  que  ingresan al  nivel  inicial, y primario, tiene como base  de la  educación  la  felicidad,  expresada en  la  alegría,  el  compartir, la  solidaridad, el  logro  de metas, desarrollo  de  habilidades y  sobre  todo el  conocer a  Jesús, a  través de la  formación  diaria, “semillitas del  Evangelio”  que  les  ayuda a ir  formando  la  inteligencia espiritual para  que  en  todo  momento aprendan a  obrar  bien, en  un  camino  de  libertad.

La  infraestructura,   equipamiento, y mobiliario  adecuado,  son  factores que responden a  una  educación  de calidad, pero  esto   no  es  suficiente.   Cuentan  con  maestros, como  agentes  transformadores de la  educación,  con actualización permanente , unida a la  participación activa, crítica-propositiva  de los  PP. MM.FF. apoyando y cooperando en  la  educación-formación   de  sus  hijos.
 
   “  Educar es  nuestra  manera de  amar  y servir”